全省水环境仍面临水体污染和局部地区水资源短缺两个问题，河流、湖泊有机污染普遍，面源污染日益突出。滇池等部分湖泊富营养化污染严重。珠江水系、金沙江水系部分河段污染较重。饮用水源水质状况不容乐观。

　　废水和主要污染物排放量及变化
　　2000年，全省废水排放总量6.75亿吨。其中，工业废水排放量3.51亿吨，占废水排放总量的52.0%，生活废水排放量3.24亿吨。与上年相比，废水排放总量增长1.5%。其中，工业废水排放量下降5.4%，生活废水排放量增长10.3%。废水中化学需氧量排放量为29.71万吨。其中，工业化学需氧量排放量为17.74万吨，生活化学需氧量排放量为11.97万吨。与上年相比，化学需氧量排放总量减少30.5%。其中，工业化学需氧量排放量下降36.9%，生活化学需氧量排放量下降18.3%。主要污染行业为食品及制糖、造纸、化学品制造业；昆明、曲靖、红河、临沧是工业废水排放的主要地区。

　主要河流水质状况

　　全省主要河流有机污染普遍。主要河流监测断面中，水质良好达到Ⅰ～Ⅲ类标准（GB3838-88，下同）的断面占30%，已受污染水质达到Ⅳ～Ⅴ类标准的断面占34%，污染严重水质劣于Ⅴ类标准的断面占36%。水功能达标的断面有46个，占38.3%。河流水质的主要污染指标为石油类、总磷、挥发酚、氨氮、铅和生化需氧量。
　　金沙江水系　　金沙江水系上中游水质良好，下游水质较差。监测断面水质达到Ⅰ类标准的占3.2%，Ⅱ类标准的占19.4%，Ⅳ类标准的占19.4%，Ⅴ类标准的占16.1%，劣于Ⅴ类标准的占41.9%。有32.3%的断面水质达到地表水环境功能要求。主要污染指标为石油类、总磷、挥发酚和氨氮。污染严重的河流为盘龙江、龙川江、螳螂川。
　　珠江水系　　珠江水系水质污染严重。监测断面水质达到Ⅱ类标准的占14.3%，Ⅳ类标准的占14.3%，Ⅴ类标准的占10.7%，劣于Ⅴ类标准的占60.7%。有25.0%的断面水质达到地表水环境功能要求，主要污染指标为石油类、总磷、挥发酚、氨氮和铅。污染严重的河流为潇湘河、泸江。
　　红河水系　　红河水系水质总体良好。监测断面水质达到Ⅱ类标准的占25.9%，Ⅲ类标准的占3.7%，Ⅳ类标准的占25.9%，Ⅴ类标准的占14.8%，劣于Ⅴ类标准的占29.7%。有44.4%的断面达到地表水环境功能要求，主要污染指标为石油类、铅和氨氮。污染严重的河流为绿汁江。
　　澜沧江水系　　澜沧江水系水质良好。监测断面水质达到Ⅱ类标准的占27.3%，Ⅲ类标准的占18.2%，Ⅳ类标准的占27.3%，Ⅴ类标准的占4.5%，劣于Ⅴ类标准的占22.7%。有45.5%的断面达到地表水环境功能要求。主要污染指标为镉和总磷。污染严重的河流为沘江和西洱河。
　　怒江水系　　怒江水系水质良好。监测断面水质符合Ⅱ类标准的占66.6%，符合Ⅲ类标准的占16.7%，符合Ⅳ类标准的占16.7%。全部断面均达到功能要求。怒江水系的主要污染指标为生化需氧量和高锰酸盐指数。
　　伊洛瓦底江水系　　伊洛瓦底江水系除个别河流外，水质已受到一定程度污染。监测断面水质符合Ⅲ类标准的占16.7%，符合Ⅳ类标准的占66.6%，劣于Ⅴ类标准的占16.7%。只有16.7%断面达到功能要求，主要污染指标是生化需氧量、高锰酸盐指数和总磷。
　　六大水系污染程度由重到轻的顺序：珠江、金沙江、红河、澜沧江、伊洛瓦底江、怒江。与上年相比，主要河流监测断面水质符合Ⅰ～Ⅱ类标准的增加5.8%，符合Ⅲ类标准的增加3.3%，符合Ⅳ类标准的减少9.1%，符合Ⅴ类和劣于Ⅴ类的与上年持平。水功能达标率增加9.2个百分点。
　　“九五”期间全省主要河流水质总体趋于好转，但局部污染依然严重。六大水系除珠江水系水质污染仍呈上升趋势外，其它五大水系均保持稳定状态或呈现缓慢下降的趋势，全省“九五”期间水污染防治已见成效。

　　主要湖泊水质状况

　　17个监测湖泊(水域)中，水质为Ⅰ～Ⅱ类的湖泊占11.8%, 水质为Ⅲ类的湖泊占11.8%，水质为Ⅳ类的湖泊占41.1%，水质为Ⅴ类的湖泊占11.8%，污染严重、水质劣于Ⅴ类的占23.5%。总体而言，清洁、较清洁湖泊占23.6%（Ⅰ～Ⅲ类）；轻污染、污染湖泊占52.9%（Ⅳ、Ⅴ类）；严重污染湖泊占23.5%（>Ⅴ类）。富营养湖泊占47.1%。湖泊水质功能达标率仅为11.8%。影响湖泊水质的主要污染指标是总磷、总氮、高锰酸盐指数、生化需氧量和非离子氨等，其中尤以总磷、总氮污染较为普遍，是导致全省湖泊富营养化的主要因素。与上年相比，水质好转的湖泊占11.8%，恶化的占23.5%，水质相对稳定的占64.7%。
　　“九五”期间，多数湖泊水质处于波动或相对稳定状态，少数湖泊水质有所好转。水质波动的湖泊占52.9%，水质相对稳定的湖泊占47.1%。杞麓湖在“九五”后三年中水质由劣Ⅴ类升为Ⅳ类，长桥海后两年由劣Ⅴ类升为Ⅳ类，大屯海由劣Ⅴ类升为Ⅴ类，水质有所好转。
　　九大高原湖泊　　泸沽湖、抚仙湖水质良好（Ⅰ类）；洱海水质较好（Ⅲ类）；阳宗海、星云湖、杞麓湖、程海受轻度污染（Ⅳ类）；异龙湖污染较重（Ⅴ类）；滇池（包括草海和外海）污染严重（劣于Ⅴ类）。九大湖泊的水功能达标率仅为22.2%。
　　滇池　　2000年滇池草海和外海水质总体仍劣于V类，与上年比较，滇池外海水质有所改善，主要水质指标总磷、总氮、生化需氧量有所下降，高锰酸盐指数与上年持平。滇池草海水质污染则有所加剧，主要水质指标总磷、总氮、高锰酸盐指数、生化需氧量均有明显上升。与2000年规划目标比较，目前滇池草海、外海三项主要控制指标高锰酸盐指数、总磷、总氮均不达标。
　　“九五”期间，草海主要污染指标高锰酸盐指数、生化需氧量、总磷前两年呈上升趋势，1998年后三项指标明显下降，但2000年草海污染又出现回升。外海主要污染指标变化不大，水质相对稳定。总之，滇池水质迅速恶化的势头得到一定程度的遏制，局部区域水质有所改善，但滇池污染发展的趋势尚未得到根本扭转，距规划的水质目标尚有一定距离。

　　措施与行动
　　废水治理 2000年，全省工业废水治理项目共319个，新增废水处理能力143.08万吨/日。废水处理设施1609套，全年工业废水处理率为84.1%；处理排放达标率为79.1%；废水处理率、处理排放达标率均高于上年。经处理去除化学需氧量169246.40吨。由于实施达标排放，化学需氧量的去除量大幅度增加，比上年增加1.8倍。
　　全省已建成城市污水处理厂9座，日污水处理能力42.5万吨，年污水处理量11021万吨。去除化学需氧量15915吨。
　　九大高原湖泊治理 省政府于2000年9月23日召开了九大高原湖泊水污染防治现场办公会，对九大高原湖泊水污染综合防治作了全面部署，确定了九大高原湖泊的治理保护目标、主要任务和重点治理工程。成立了九大高原湖泊水污染综合防治领导小组，并决定本届政府任期后两年，每年投资5000万元专项资金用于九大高原湖泊水污染综合防治。省政府与九大高原湖泊所在地（州、市）政府签定了目标责任书。
　　滇池作为国家 “三河三湖”综合治理重点，“九五”期间，滇池治理工程全面实施。建成4座污水处理厂，污水日处理能力36.5万吨；实现了滇池流域工业企业达标排放；实施了滇池草海底泥疏竣工程，疏竣底泥424万万立方；在流域内禁止经销和限制使用含磷洗涤用品；通过采取一系列措施，草海水质达到国务院要求的第一阶段水质目标，滇池水污染防治工作取得阶段性成果。
　　达标排放 全省2000年达标排放重点考核废水排放污染源654家，排污口695个，通过实施达标排放，这些污染源与1996年相比，废水排放量减少26%，废水中化学需氧量、悬浮物、石油类、氰化物、氨氮分别削减63%、85%、71%、71%、92%，重金属排放量也有较大削减。
　　六大水系水污染防治 积极开展“长防”、“长治”、“珠防”等工程，在金沙江流域和西双版纳州全面禁止采伐天然林。通过采取各种措施，六大水系流域内森林覆盖率逐步回升。完成了金沙江流域水污染防治和生态保护规划。