云南省是全国生物多样性最丰富和全球生物多样性的热点地区。目前生物多样性正受到威胁，保护生物多样性刻不容缓。
  物种 云南各种动植物种数均接近或超过全国动植物种数的一半以上，其中哺乳类296种，占49.9%；鸟类792种，占66.5%；两栖类102种，占44.1%；爬行类151种，占39.2%；淡水鱼类399种，占50%左右；高等植物15000种以上，约占60.0%。
　　濒危保护物种 全省列为国家重点保护的野生动物共164种,占全国重点保护野生动物种数（257种）的63.0%。其中一类保护动物44种,二类保护动物119种。
　　列为国家重点保护的野生植物共151种,占全国重点保护野生植物种数（354种）的42.6%,其中一类保护植物4种,二类保护植物56种。
　　湿地 全省境内分布有河流、湖泊、水库、高山沼泽等类型的湿地，有代表性的主要有丽江拉市海、中甸县纳帕海、腾冲县北海湿地、白马雪山垭口、碧罗雪山东坡安切来垭口等沼泽湿地。

　　自然保护区 到2000年底，全省共建立自然保护区121个(国家级8个、省级49个、地（州、市）和县级64个)，其中：森林生态系统类型79个，野生动植物类型23个，内陆湿地水域生态系统类型6个，地质和古生物遗迹类型4个，自然与文化综合体类型9个。全省保护区面积已达240多万公顷，占全省国土面积的6.1％。西双版纳、高黎贡山国家级自然保护区还被联合国教科文组织批准为世界生物圈保护区。“九五”期间新增和扩建国家级自然保护区4个，新建和扩建省级自然保护区9个，新增保护区面积40多万公顷。

　　措施与行动
　　加大自然保护区建设管理力度 2000年4月国务院正式批准建立了西双版纳纳板河流域和无量山两个国家级自然保护区，批准扩大白马雪山国家级自然保护区和将怒江省级自然保护区纳入高黎贡山国家级自然保护区。全省已有白马雪山、高黎贡山、无量山、西双版纳、南滚河、苍山洱海、纳板河流域和哀牢山8个国家级自然保护区，总面积110万公顷。组织完成了南华大中山省级自然保护区并入哀牢山国家级自然保护区论证以及金平分水岭、大围山等自然保护区申请建立国家级自然保护区的论证和申报工作。
　　新建珠江源省级自然保护区和腾冲火山热海等一批地（州、市）和县级自然保护区。新增自然保护区面积20多万公顷,大大推进了自然保护区的建设进程。
　　生态环境的现状调查 进行全省生态环境的现状调查，较全面掌握全省生态环境现状和动态变化，完成了云南省生态环境现状调查报告。