全省生态环境保护与建设步伐加快，生态建设和生态破坏的恢复工作取得进展。目前存在的主要问题是：森林生态功能衰退，生物多样性受到威胁，农村生态环境破坏和面源污染日趋突出，水土流失仍很严重，边治理边破坏的现象依然十分突出，生态灾害严重。生态破坏已成为影响我省经济社会发展的重要因素。

　　物种 云南各种动植物种数均接近或超过全国动植物种数的一半以上，其中哺乳类296种，占49.92%；鸟类792种，占66.48%；两栖类102种，占44.12%；爬行类151种，占39.22%；淡水鱼类399种，占50%左右；全省有高等植物426科、2,592属、17,000多种，科、属、种分别占全国的88.4%、68.7%、62.6%。
　　濒危保护物种 我省列为国家重点保护的野生动物共164种，占全国重点保护的野生动物种数（257种）的63%，其中一类保护动物有滇金丝猴、亚洲象、绿孔雀等44种，二类保护动物120种。
　　列为国家重点保护的野生植物共117种,占全国重点保护的野生植物种数（254种）的46%,其中一类保护植物有苏铁、华盖木、红豆杉等22种,二类保护植物95种。
　　湿地种类与面积 全省有湖泊湿地、沼泽湿地、季节性湖泊湿地、河流湿地等天然湿地和水库、池塘等人工湿地。全省湖泊面积约116,400公顷，其中面积达1平方公里以上的湖泊有37个，总面积96,621公顷；河流面积约120,240公顷；沼泽面积约3,950公顷。

　　自然保护区
　　截止2001年底，全省共建立自然保护区146个(国家级10个、省级46个、地（州、市）级37个、县级53个)，其中：森林生态和野生动植物类型110个，内陆湿地水域生态系统类型10个，地质和古生物遗迹类型5个，自然与文化综合体类型21个。保护区面积已达273万公顷，占全省国土面积的6.9％，自然保护区的数量居全国第一位，形成了各种级别、多种类型的保护区网络。

　　肥料和农膜 据不完全统计，2001年全省施用有机肥7500万吨，比2000年增加300万吨；施用化肥（折纯）205万吨，比2000年增加7.8万吨。农膜使用面积20多万公顷，使用量1.2万吨。

　　措施与行动
　　《全国生态环境保护纲要》实施 省政府下发了《关于认真贯彻全国生态环境保护纲要的通知》；开展了滇西北国家级重要生态功能区的建设试点工作；完成了全省生态环境现状调查；通海县通过了国家级生态示范区验收；开展了有机食品认证及管理工作；在机场附近、高速公路和铁路沿线及环境敏感地区划定了秸秆禁烧区；积极开展了推广农业平衡施肥、生物肥的试点。
　　加大自然保护区建设和管理力度 2001年6月国务院批准建立了大围山和金平分水岭两个国家级自然保护区。至此，全省已有白马雪山、高黎贡山、无量山、西双版纳、南滚河、苍山洱海、纳板河流域、哀牢山、大围山和金平分水岭10个国家级自然保护区，总面积120万公顷。组建了云南省第二届省级自然保护区评审委员会，组织完成了昭通大山包等自然保护区申请建立国家级自然保护区的评审、论证和申报工作。
　　新建了楚雄三峰山、师宗菌子山以及弥渡大黑山等一批地（州、市）级和县级自然保护区。全省新增自然保护区面积30多万公顷。
　　制定并颁布了《云南省生态建设和环境保护"十五"规划》 《云南省生态建设和环境保护"十五"规划》是"十五"计划的重点专项规划之一，对我省实施可持续发展战略，保证经济、社会与环境协调发展具有积极指导意义。

　　野生动植物保护及自然保护区建设 全国野生动植物保护及自然保护区建设工程启动。当年安排我省国家级自然保护区建设资金3,122万元。一批国家级自然保护区的基础设施建设正在展开。
　　农村能源建设 2001年全省新建沼气15.4万户，年建沼气数跃居全国第二位，累计达到62.2万户。国家农村能源项目安排资金314万元，在我省7个县（市）开展农村沼气和秸秆气化集中供气项目；中央和省用于沼气建设的各种资金达到3,600万元。
　　水土流失治理 全省共完成水土流失治理2,007.48平方公里，新实施保护面积4800平方公里，全面完成国家计划。共计完成投资23,499.32万元。