全省水环境仍面临水质污染和局部地区水资源短缺，城市污染和农村面源污染仍较突出。全省水环境质量基本稳定，部分水域质量有所好转。城市河流普遍受到有机污染。部分湖泊富营养化仍较突出。

　　主要河流水质
　　全省主要河流普遍受到有机污染。六大水系受污染程度最重的仍为珠江水系，最轻为怒江水系。
　　主要河流监测断面中，水质良好达到Ⅰ～Ⅲ类标准（GB3838-2002，下同）的断面占43.3%，河流已遭污染水质达到Ⅳ～Ⅴ类标准的断面占23.3%，污染严重水质劣于Ⅴ类标准的断面占33.4%。
　　水环境功能达标的断面占51.7%。河流水质的主要污染指标为总磷、氨氮、生化需氧量、铅和高锰酸盐指数。

　　
　　金沙江水系
　　 金沙江上游水质良好，中游已受污染，下游污染较重。监测断面水质达到 I～III类标准的占29.0％；Ⅳ～Ⅴ类标准的占29.0％；劣于V类标准的占42.0％。水环境功能达标的断面占45.2%。主要污染指标为总磷、汞、氨氮和氟化物。污染严重的河流为螳螂川、普渡河和盘龙江。
　　珠江水系
　　珠江水系水质污染严重。监测断面水质达到 I～III类标准的占7.1％；Ⅳ～Ⅴ类标准的占28.6％；劣于V类标准的占64.3％。水环境功能达标的断面占10.7%。主要污染指标为总磷、氨氮和挥发酚。污染严重的河流为泸江、潇湘河和北盘江。

　　红河水系
　　红河水系水质已受污染。监测断面水质达到 I～Ⅲ类标准的占51.8％；Ⅳ～Ⅴ类标准的占18.5％；劣于V类标准的占29.7％。水环境功能达标的断面占63.0%。主要污染指标为铅和高锰酸盐指数。污染严重的河流为三家河和小河底河。
　　澜沧江水系
　　澜沧江水系水质已受轻微污染。监测断面水质达到 I～Ⅲ类标准的占72.7％；Ⅳ～Ⅴ类标准的占22.8％；劣于V类标准的占4.5％。水环境功能达标的断面占77.3%。主要污染指标为生化需氧量和高锰酸盐指数。污染严重的河流为罗闸河。
　　怒江水系
　　怒江水系水质良好，少数支流受轻微污染。监测断面水质达到 I～Ⅲ类标准的占83.3％；Ⅳ类标准的占16.7％。水环境功能达标的断面占83.3%。主要污染指标为高锰酸盐指数和生化需氧量。
　　伊洛瓦底江水系
　　伊洛瓦底江水系水质良好。所有监测断面水质均达到 Ⅱ～Ⅲ类标准，都达到功能要求。
　　六大水系受污染程度由重至轻的顺序：珠江水系、金沙江水系、红河水系、澜沧江水系、伊洛瓦底江水系和怒江水系。与上年相比，水质符合Ⅰ～Ⅲ类标准的断面增加15.8%，符合Ⅳ～Ⅴ类标准的断面减少18.3%，劣于Ⅴ类标准的断面增加了2.5%。达到地表水环境功能的断面增加了10.0%。

　　主要湖泊水质
　　全省受污染湖泊以有机污染为主，部分湖泊富营养化突出。20个主要湖泊（水域）中（滇池分别按草海、外海进行评价），水质为Ⅰ类的占5.0%；水质为Ⅱ类的占15.0%；水质为Ⅲ类的占30.0%；水质为Ⅳ类的占5.0%；水质为Ⅴ类的占15.0%；污染严重，水质劣于Ⅴ类的占30.0%。总体而言，清洁、较清洁的湖泊（Ⅰ～Ⅲ类）占50.0%；污染、重污染的湖泊（Ⅳ、Ⅴ类）占20.0%；严重污染湖泊占30.0%。50.0%的湖泊水质处于不同程度的富营养状态。其中，滇池草海、滇池外海分别处于重富营养和中富营养状态。主要湖泊的水环境功能达标率为25.0%。影响湖泊水质的主要污染指标是总磷、总氮、生化需氧量等。
　　与上年比较，主要湖泊中，水质为Ⅰ～Ⅲ类的比例由47.0%下降到41.2%；水质为Ⅳ、Ⅴ类的比例由11.8%升为23.5%；水质劣于Ⅴ类的比例由41.2%降为35.3%；水质保持相对稳定的湖泊占47.0%。

　　九大高原湖泊
　　水质为清洁、较清洁和受到不同程度污染的湖泊各占一半。泸沽湖Ⅰ类，抚仙湖、阳宗海Ⅱ类，水质优良；洱海、程海Ⅲ类，水质良好；滇池外海、星云湖、异龙湖Ⅴ类，水质为重污染；滇池草海、杞麓湖劣于Ⅴ类，水质受到严重污染。九大高原湖泊的水环境功能达标率为20.0%。影响水质的主要污染指标是总氮、总磷。
　　与上年相比，因个别指标变化使部分湖泊的水质类别的有所改变。抚仙湖因总氮值增加，水质由Ⅰ类降为Ⅱ类；洱海因总磷值增加，水质由Ⅱ类降为Ⅲ类；星云湖因总磷值增加，水质由Ⅳ类降为Ⅴ类；异龙湖因总氮值下降，水质由劣于Ⅴ类升为Ⅴ类；滇池外海因总氮、总磷值下降，水质由劣于Ⅴ类升为Ⅴ类。
　　滇池 　　草海水质劣于Ⅴ类，主要污染指标总氮、总磷、氨氮、生化需氧量均超Ⅴ类标准，高锰酸盐指数Ⅳ类。外海水质Ⅴ类，主要污染指标总氮、总磷均为Ⅴ类，生化需氧量Ⅳ类。
　　与上年比较，草海水质类别不变；外海水质有所好转，由劣Ⅴ类升为Ⅴ类。草海主要水质指标高锰酸盐指数由Ⅴ类升为Ⅳ类，其它指标年平均值有所下降。外海主要的水质指标总磷、总氮由劣Ⅴ类升为Ⅴ类，其它指标年平均值均下降。

　　地下水水质
　　在7个地下水监测盆地中，昆明监测区内孔隙地下水水位除地表水补给较好的地段略有回升外，其余地段地下水水位较2001年仍持续下降，年均水位降幅0.11米～0.31米。
　　地下水流量动态主要受年降雨量的影响较大，各监测区内总体上流量动态变化不大。
　　浅层孔隙水仍然以较差级为主，污染呈面状分布，亚硝酸盐氮、硝酸盐氮、氯化物、锰、大肠菌群、细菌总数普遍超标。仅在盆地边缘地带，孔隙水水质较好。基岩水(裂隙水、岩溶水)水质以良好级为主，仅个别地段出现污染，污染状况多呈点状或岛状分布。

　　废水和主要污染物排放及变化
　　全省废水排放总量66,271.02万吨，比上年增长3.3%，废水中排放化学需氧量30.09万吨；氨氮1.81万吨。其中，工业废水排放量33,696.02万吨，占废水排放总量50.8%，比上年增长3.0%，工业废水中排放化学需氧量12.03万吨，比上年下降14.2%；氨氮3,106.49吨，比上年下降16.2%；其它污染物524.34吨。工业废水及污染物排放的主要行业是食品加工、化工、造纸、金属冶炼和采选业；主要排放地区是昆明市、德宏州、红河州等；主要排放水系是珠江水系、金沙江水系和澜沧江水系。

　　措施与行动
　　九大高原湖泊水污染防治及投资
　　截止到2002年12月底，省政府确定的51个重点项目已基本完成45项，在建6项。九大湖泊所在五地、州（市）与省政府签定的2001—2002年目标责任书确定的105个治理项目，已基本完成95项，在建7项，进行前期工作的3项。
　　2002年，九大湖泊水污染治理投资7.41亿元，其中滇池投资5.18亿元。九大湖泊水污染治理累计投资43.08亿元，其中滇池治理投资34.32亿元。

　　工业废水治理
　　全省工业废水治理投资9,465.2万元，建设废水治理项目115项，新增废水处理能力16.1万吨/日；截止到2002年底，全省建成工业废水治理设施1,621套，废水处理设施处理能力354.6万吨/日；工业重复用水率82.8％，工业废水排放达标率65.8％。
　　金沙江流域治理
　　国家《三峡库区及其上游水污染防治规划》涉及我省项目共45个，各地加快了项目前期工作。在建项目10个，其中污水处理项目6个，垃圾处理项目4个；正在进行初步设计的项目13个；正在进行可研的项目22个。